22 féle betegség van a játékban, mindet el kell kapni egyszer a Challenge teljesítéséhez.
Betegséget elkapni lehet fertőzött lényektől(A nevük mögött van egy ikon ami a fertőzöttséget jelzi), mérgező levegőtől(Toxikus vagy füst), nyílt víztől, nyers vagy romlott ételtől.
The Blight: Ezt Scorchedbeast, Grafton monster, Mirelurk Queen vagy Megasloth-tól kaphatjuk el.
Blood worm: Radroach.
Bone worm: Mole rat, Radrat vagy fából készült csapódó csapda.
Buzz brain: Ant.
Dysentery: Nyers Répa, Romlott hús vagy toxikus vízben úszkálás.
Fever claw: Mirelurk Hunter.
Flap limb: Murelurk.
Glowing pustules: Glowing One vagy Gloving Radstag.
Heat flashes: Honey beast.
Jelly fingers: Stingwing
Lock joint: Farkas.
Needle spine: Angler.
Parasites: Tick, Bloodbug, nyers mutfruit, vízben úszás.
Rad worms: Feral ghoul, mutant hound.
Rattle hands: Mirelurk king.
Shell shock: Mongrel, Deathclaw.
Sludge lung: Wendigo, toxikus levegő.
Snot ear: Snallygaster vagy Gulper.
Swamp gas: Boatfly.
Swamp itch: Földön lévő matracon vagy köszös ágyon alvás.
Weeping sores: Radscorpions vagy Yao guai.
The Woopsies: Mirelurk spawn.
Acquire different Kind of Diseases (22)
